Редкие доброкачественные генетические варианты гена выживания мотонейронов выявили в ходе расширенного неонатального скрининга у 5 новорожденных
Специалисты Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова (МГНЦ), референсного центра федеральной программы расширенного неонатального скрининга, выявили 2 ранее неизвестных изменения нуклеотидной последовательности гена SMN1 у 5 новорожденных из республик Татарстан и Башкортостан. Статья вышла в журнале «Gene»
В ходе скрининга в 2023 году генетики проанализировали образцы, полученные от 1 227 130 новорожденных в Российской Федерации для выявления спинальной мышечной атрофии 5q (СМА 5q). На первом этапе исследований в группу риска попали 253 образцов. В 121 случае диагноз был установлен – в гене SMN1 была выявлена делеция, то есть, удаление одного из участков гена, которая ведет к заболеванию. Специалисты отметили, что в 5 образцах различные методы исследования не дали однозначного результата: одни методы показывали, что в гене произошла делеция, другие говорили, что делеции нет и ген может выполнять свои функции.
Для всех пяти таких образцов провели дополнительный анализ, включая исследование родителей, братьев и сестер, а также анализ РНК продукта гена SMN. Для того, чтобы определить, могут ли выявленные генетические варианты причиной заболевания или являются вариантами нормы – проявлением генетического разнообразия различных популяций. Один из вариантов генетики классифицировали как вероятно доброкачественный, то есть, он не приводит к развитию болезни. Другой даже после проведенных исследований остался вариантом неясного клинического значения, для оценки патогенности которого необходимо накопление популяционных данных и наблюдение за состоянием здоровья новорожденных с данным вариантом. Сейчас все дети с редкими вариантами в гене SMN1 находятся под наблюдением врачей, симптомы спинальной мышечной атрофии у них не отмечаются.
Ольга Щагина, заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики №1, ведущий научный сотрудник лаборатории ДНК-диагностики МГНЦ: «В геноме каждого человека есть несколько десятков тысяч отличий от референсного генома. Большинство таких замен являются доброкачественными, то есть, не приводящими к болезням, а обеспечивают разнообразие вида. Скрининг всех российских новорожденных проводится с целью формирования группы риска по наследственным заболеваниям, для которых существует эффективная терапия, в том числе СМА. Случайное выявление в рамках скрининга ранее не описанных генетических вариантов у новорожденных ставит перед генетиками сложную задачу по уточнению их патогенности, так как от этого зависит необходимость назначения дорогой и тяжелой терапии, а симптомы болезни отсутствуют у большинства новорожденных как с обычными делециями SMN1, так и с такими неизвестными вариантами. В данном случае нам удалось провести комплексное исследование и уточнить отсутствие влияния данных вариантов на экспрессию белка SMN, соответственно новорожденные с крайне высокой долей вероятности будут здоровы и не нуждаются в терапии.
В мире еще не было новорожденных с такими вариантами, поэтому ни у врачей, ни у ученых нет опыта, мы не знаем всех возможных механизмов проявления патогенного действия не описанных ранее вариантов, нами изучен только наиболее вероятный механизм, мы не знаем всех возможных механизмов проявления патогенного действия не описанных ранее вариантов, нами изучен только наиболее вероятный механизм. Поэтому все эти дети находятся под динамическим наблюдением врачей генетиков своих регионов. Если все-таки симптомы СМА у них проявятся, немедленно будет начата эффективная терапия для предотвращения инвалидизации. Скрининг на СМА новорожденных от пилотных проектов до массового обследования внедряется во многих странах мира после появления эффективной терапии данной болезни. Приведенная в нашей работе информация имеет огромное значение для правильной интерпретации результатов скринингового исследования»
Федеральная программа расширенного неонатального скрининга стартовала в России в январе 2023 года. Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова является референсным центром программы – здесь устанавливают молекулярный диагноз у новорожденных, попавших в группу риска по результатам скрининга, также МГНЦ ведет методическое руководство программой. На сегодняшний день диагнозы различных наследственных болезней по результатам расширенного неонатального скрининга установлены более чем у 600 новорожденных.